赵曼熊斯基决定，首先要从组织架构和指导方针上刷新整个机构。他考虑了一晚上之后，写了一份《政治保卫工作备忘录》，抄报给全体执委。
赵曼熊斯基在《备忘录》中指出：国家政治保卫总局的职能是：在整个穿越国家的管辖范围之内，依照《共同纲领》之规定，在仲裁庭的管辖之下，执行侦察、压制和消灭政治上、经济上一切反穿越集团的组织活动、侦探及盗匪等任务。
“秘密工作是保卫局工作的主要原则”、“在侦察和监视敌对派别活动或嫌疑分子时，必须是绝对秘密的”。同时，政治保卫总局以集权的系统组织，经常性系统性地检举和消灭一切公开的、秘密的暗藏的敌对组织及行动，以保卫和巩固政权。
为了确保这个部门的战斗力，它必须有严密且强有力的组织和执行各种特殊任务所必须的特殊权力。赵曼熊斯基在备忘录里专门撰写了一节：《政治保卫局组织纲要》。
由于现在穿越集团的占据地方还很小，没必要太大太全面，所以现阶段的政治保卫总局只设置侦查、执行和技术三个处。撤销无人主持的敌工部和社会工作部。政治保卫总局暂时也不设置外地分支机构。而是采取在需要派遣政治保卫工作人员的地方采用“特派员”的方式。
赵曼熊赋予侦察处的责任是：一、承受局长命令，办理侦察处一切事宜；二、计划编制和训练公开及秘密侦查等工作事宜；三、审查侦查获得的材料及预审口供；四、办理邮电书报检查、水陆交通事宜；五、布置内保“隐干”事宜；六、负责政治鉴定工作。
执行处负责：一、承受局长命令，办理执行处一切事宜；二、计划编制地方保卫机构的政治、军事等训练，与枪支、子弹、装备等一切管理事宜；三、办理拘捕、处置、解送、管理人犯等事宜；五、办理总局及各地方机构一切统计事宜；六、办理预审，整理口供，提出审讯处置意见，送交法庭事宜。
技术处负责：一、承受局长命令，办理技术处一切事宜；二、分管、储存、维护各种技术装备；三、按照条例规定支持各处活动；四、进行技术侦查活动。
另设办公室作为局长直接领导的部门，分管：总局全部行政事务；保管秘密文件及搜获的证物，进行秘密交通。
这个组织架构上报之后很快得到了冉耀的批准。为慎重起见，他还专门抄报给全体执委。执委们全部在抄件上画了圈。无人提出反对的意见。