黄巢洞悉当时的形势，北方虽然遭遇旱灾，但是北方人素来民风彪悍，士兵也颇为勇敢。所以在河南一带活动，并不会有多大的益处，他把目标定在了南方。
说干就干，黄巢率军南下进攻宣州，在南陵为官军所败；于是又进入浙东，经婺州至衢州，然后披荆斩棘，攻入福建。福州观察使韦岫弃城而逃。
黄巢军队冲进福州，这支军队再也不是那支为了自己的生存而抗争的军队，他们见人就杀，见房子就烧，情景恐怖之极
黄巢占领福州后，又开始向南运动，包围广州。
在此期间，黄巢曾致书浙东观察使崔璆、岭南东道节度使李迢，要求朝廷封自己为天平节度使。二人惧怕黄巢威势，极力申奏，但朝廷不许。黄巢不甘心又自己上书，求为广州节度使，可朝廷只授予他府率的官职，并遣使慰问。
黄巢假装接受，置酒款待。这位钦使素来嗜酒，一杯未了，又是一杯，接连喝了数十杯，不觉喜极欲狂，随口乱语。当下笑对黄巢道：“闻足下喜吃人肉，究竟人肉有甚滋味？”
黄巢听了此语，知他有意嘲笑，也忍不住忿怒起来。原来他前时攻打郑州时，因粮食短缺，专掳妇女婴孩，或烹或蒸，作为食品，尝语徒众道：“世间美味，无过人肉，但使他国有人，何忧饥馁。”因此每破州县，不惜仓粟，往往焚去，现在闻钦使相诘，遂勃然道：“人肉最美，吃醉人肉，越加适口，好似吃糟猪呢。”
钦使骂道：“无知狂贼！你今日归朝，不过一个唐家奴，还想吃醉人肉么？”
黄巢此时亦含酒意，瞋目骂道：“吃你何妨！”
说至此，即指麾左右，就座上拿下钦使。钦使随员只有数人，哪里招架得住？都被他陆续捆住，一刀一个，尽行杀死。黄巢吩咐军士将他们洗刷烹调，供大家饱餐一顿。可怜钦使招降不成，转眼成了人家的盘中餐，腹中肉。
这年九月，广州失守。
黄巢攻陷广州后，发现这是一个不同于中原的世界，这里再也不是什么蛮荒之地，这里充满了富庶，且有着外夷文化的冲击，各种宗教更是在这个城市中交互错杂。黄巢连番血战，粮草早已殆尽。所以，又一番新的抢掠开始了，黄巢军见人就杀，看到值钱的东西就抢，不值钱的一把火烧掉。
当黄巢的军队到达广州港口后，黄巢惊呆了！因为大批的外国商船停靠于此，船上的货物不计其数。还有很多要出使外国的商船，这些船上也装着中国最好的特产。
黄巢立即下令，把这些商船上的货物全部收缴充当军费。码头上的水手和各国商人全部杀死！
一时间，广州码头尸积如山，海水都被染成了红色。被杀的人包括回教徒、基督教徒、犹太人及平民。
这件事情造成了极坏的国际影响，唐僖宗听闻大怒，一向自由、开放、和平的唐王朝形象遭到了极大的破坏。唐僖宗此时恨透了黄巢，从太宗皇帝到现在，唐朝威仪一直广播世界，但是现在却发生了这样的事情。唐僖宗下定决心，一定要除掉黄巢这个败类！
唐僖宗此时派出了淮南节度使高骈。广明元年（公元880年）三月，高骈遣其猛将张璘渡江南下。
不可一世的黄巢终于遇到了能与之抗衡的宿敌。黄巢且战且败，退守饶州。张璘又乘胜进军，黄巢无奈退守信州。此时，各地节度使的援军也已赶到，眼看黄巢的军队就要土崩瓦解、烟消云散。