但石敬瑭不这样想，对于这位逃难来的皇帝并不热心。他和桑维翰商议，桑维翰认为这个皇上已经没有什么用处，建议石敬瑭早作打算。
李从厚自己心里惴惴不安，但他的手下却没有这个觉悟，仍然觉得自己是天子卫率吆五喝六。石敬瑭再也不能忍耐，暗中指使牙内指挥使刘知远率兵将李从厚的手下全部杀死，这下李从厚彻底成为孤家寡人，石敬瑭将他软禁起来。
不久李从珂降封李从厚为鄂王，同时写信命石敬瑭送李从厚入朝。
石敬瑭得书左右为难，召军师桑维翰问道：“今得新天子书信，令我送李从厚入京，我乃从厚亲姐夫，从厚一旦入京必死无疑；倘若不去，李从珂必言我抗旨不遵，如之奈何？”
桑维翰道：“以下官之见，主公应当送李从厚入京，用李从厚人头换两年太平。”
石敬瑭问：“何人可担此任？”
桑维翰道：“主公势力不及李从珂，若派部将前往反易归附李从珂。能当此任者非主公之妻永宁公主。即便李从珂扣押公主，也不敢轻举妄动。”敬瑭听了连声称是。
石敬瑭依照桑维翰之计，遣永宁公主送鄂王李从厚入京师。李从珂一听大喜，对军师韩昭胤说道：“朕命石敬瑭送鄂王回京，没想到石郎真的令永宁公主送鄂王入京。”
韩昭胤道：“既然永宁公主亲往京师，主公万不可让永宁公主再回太原。”
从珂问：“何出此言？”
韩昭胤道：“先帝未阻契丹南侵，令石敬瑭镇守太原手握重兵，石敬瑭又与陛下幼年旧交，对陛下知根知底，实乃朝廷大患。今永宁公主入京，陛下可将其扣为人质善养厚待，石敬瑭必定不敢造反。”李从珂大喜依计而行。
鄂王李从厚被送至京师，李从珂降旨贬于卫州，即日前往。李从厚仅得马车两驾随从数人。马车行至半路，忽见前方闪出蒙面者百人，刀枪林立拦住去路。李从厚大惊问道：“敢问诸位何处好汉？”其中一蒙面人说道：“来者可是鄂王李从厚?”李从厚答道：“小王正是。”
只见那人一挥手，几个刽子手举刀上前砍了车夫和随从，李从厚吓得抱头哀求。那蒙面头目提刀走到近前，把面罩一拉说道：
“吾乃潞王麾下大将杨光远，奉密诏在此取你性命。”
李从厚伏地痛哭：“杨将军何不留小王一命，从厚定为将军立长生牌位，永志大恩。”
“恕难从命！天子念与殿下兄弟之情，赐汝自裁！”杨光远将刀递于李从厚。李从厚接刀嚎啕而哭，少时自刎而死，时年二十一岁。
李从厚的妃子孔氏【即孔循女】尚居宫中，生子四人，俱属幼稚。李从厚死后，李从珂遣人语孔妃道：“我儿李重吉、女儿惠明何在？你等还想全生么？”孔妃顾着四子只是悲号。不一时便有人进来持刃乱斫，孔妃与四子一同毕命。【李从厚杀死李从珂儿女，李从珂却要他六人抵命，报应太快】。
磁州刺史宋令询闻故主遇害，恸哭半日自缢而亡。
李从珂即改元为清泰元年，大赦天下，葬明宗于徽陵，并从荣、重吉遗棺，及故主李从厚遗骸，俱埋葬徽陵域中。李从厚墓土才及数尺，不封不树令人悲叹。至后晋石敬瑭登基，才追谥李从厚为闵帝。
李从珂任用庸才为相，致使国事日益败坏，民间怨声四起。加之李从珂是以养子身份篡位，各地藩镇多有不服，尤其是作为明帝女婿的石敬瑭。石敬瑭自恃身份比李从珂高，而且同样功勋卓著，对于李从珂抢班夺权的行为很是不满，于是就有了取而代之的想法。
而李从珂对石敬瑭素来忌惮，虽然口中说着“石郎于朕至亲，无可疑者”，但实际上处处提防，以备“流言不息，万一失欢”。