这属于从连载版继承下来的毛病，因为当初一边连载一边更新，剧情有时候会有很明显的漏洞。
所以在新修版，金镛先生有意把这些漏洞一一补齐。
比如曲灵风，在陈梅两人盗经书几年前就被逐出桃花岛，因为大徒弟的他，发现黄药师对待梅超风有异样的情感，直言不讳，结果被恼羞成怒的黄药师打断双腿驱逐。
后两年，黄药师娶了冯蘅，这女子比梅超风岁数还小些。聪明的冯蘅一下就发现黄药师心中有梅超风，所以特意拿话点着梅超风。陈梅两人也是因此，才偷盗《九阴真经》离开桃花岛。不然以黄药师一向护犊子的性子，很难想象他们会只是怕有私情被恩师知道而背叛师门，如果相恋和二人也发现黄药师实际喜欢梅超风，这就符合逻辑了。
几年后，陈梅二人在江湖中以人练功，才闯出“黑风双煞”的匪号。而身怀六甲的冯蘅察觉到丈夫心中依旧念着梅超风，怀孕中失了智，所以强行默写《九阴真经》，进而早产后去世，黄药师这才如梦初醒，悔恨不已，随即迁怒于众弟子。
黑风双煞得到信儿，还偷着回桃花岛祭拜师母，被黄药师发现，因为黄蓉及时哭泣而放弃杀死两人。陈梅二人却是吓破了胆，不敢再在江南地界待，而是跑到长江以北。
同时根据新修版小说的设定，柯镇恶的双眼不再是梅超风打瞎的，而且他从未与“黑风双煞”见过面。他的双眼是年轻时与人争斗受了重伤而瞎，不过他的大哥柯辟邪确实是死在了“黑风双煞”的手里，可是那一战柯镇恶并没有参与，因为他当时已在山东寻找李萍母子。而且柯辟邪不是路见不平，而是受人之邀去围攻陈梅二人，这个邀请人就是陆乘风，柯辟邪还曾派人来通知柯镇恶。也是这样，柯镇恶才会知道“黑风双煞”的手段一事。
还有就是修改了黑风双煞与柯辟邪一战的时间，推后到了江南七怪在大漠找到郭靖的两年前，可见众人围攻，足足追杀了黑风双煞四年的时间，也是这样才把双煞逼到了大漠。这也是说在郭靖四岁的时候，陈玄风和梅超风才打死了柯辟邪，而这一战发生在陈梅二人重回桃花岛之后，那时候的黄蓉刚好一岁多，这样就符合了郭靖比黄蓉大两三岁左右的设定。一同修改的，还有荒山一战时梅超风的年龄，由原来的四十岁改成了二十几岁，以对应黄蓉比郭靖小的设定。
这样一改，逻辑就顺当多了，只是黄药师从一个痴情人改成了心有小三的男人，不再完美，让人一时接受不能。
“实际这才是一个人，”苏浩说道，“之前的版本都把黄药师塑造的太完美了，学识渊博，武功绝顶，可谓文武双全！重要的是对待妻子一心一意。除了盛怒之下爱迁怒人、恃才傲物外，没有缺点了。就算他伤害了他那帮弟子，但那些弟子却没一个恨他的，反而各个想用自己的方法能讨黄药师欢心，期望回到师门。”
“但这样太过完美的人，现实里的人只能仰望，完全代入不了，更遑论共情了。”张松文赞同的点了点头。
“事实上，在我理解，黄药师是一个很矛盾的人，他批判儒家，却一副书生打扮；
他漠视传统礼教，却最敬重忠臣孝子；
他行事亦正亦邪，教的徒弟基本都是邪门歪道，自身却很赞赏侠义行为。
矛盾统一，犹如太极一体两面，这才是一个人。”
苏浩说着，脚下不停，依旧是稳稳的四方步，但步伐缓缓加快。
身形微微侧立，上身依旧挺拔，脸上表情不变，只是眼神放空些许，眼角微微上挑。
整个人明明依旧是书生打扮，书卷气十足，却瞬间多出三分邪气、三分傲气。
“啪啪啪～～”
张松文忍不住拍起手来，“棒！阿浩，这个人物你已吃透了五分了！剩下的——”
说着，他举起一旁的剧本，“下面可以开始对台词了。”