对一种生物感染，然后控制它的行为，是瘟疫真菌的新反击方式，最开始，脑经常去寻找一些较为强大的生物，不过那并不是很好找，敌军依旧慢慢地在摧毁着它所占领的地盘。
这个和瘟疫真菌战争的生物种族，琳暂时称其为‘亚特种群’，并没什么特别的意思，但琳觉得它们可能和印加虫群有关系，按照‘脑’的记忆来看，‘亚特种群’的能力和印加虫群非常的相似，但它们的族群习性有些不一样……
因为被感染的生物是有限的，强大的生物更是稀少，为了对付‘亚特种群’，脑想出了一个新计划，将那些被感染的生物组合到一起。
这个就叫做‘瘟疫之首’计划，其实这是琳起的名字。
脑试图将一些巨大的生物组合成一个生物，然后再以硬化的菌丝包裹起来，用于作战，这时脑发现它难以指挥太多的被感染生物，于是它特地感染了一些生物，用于传播信息使用，于是真菌领主就这么诞生了……
许多被感染的生物在五座岛附近的深海之下被制造成瘟疫之首，脑的原定计划是将它们制造成一种庞大无比，体型如……飞龙一般的生物。
飞龙？这块记忆区突然冒出了飞龙的摸样，琳感到有些奇怪，之前还没出现过有关于飞龙的记忆，可能是这个脑的记忆不完整所造成的这种情况。
脑的计划没有成功，亚特种群已经打到了瘟疫五岛附近，几乎所有的瘟疫之首都基本还是在未完成品的状态，脑将它们藏到了岛屿之中。
面对疯狂的亚特种群，脑几乎没有办法，但就在最后的防线瓦解之前，它发现它能够感染并且控制亚特种群的兵种。
它那时还是第一次试验这种事情，之前它都是杀掉这些兵种，于是它立刻大量地控制起亚特种群，让它们开始‘自相残杀’，以这种控制方式，脑慢慢地取得了优势，亚特种群依靠吞噬别的生物来增强自身，但它们找不到免疫真菌感染脑部的生物。
瘟疫真菌通常是通过将菌尘大量扩散，一般先是感染亚特种群的食物，让它们吃下后感染，有时则能直接感染部队，对不同的兵种有着不同的方式，因为每次都能感染相当大量，瘟疫真菌甚至等于把敌军转化了为自己的部队。
但是亚特种群也在研究不被感染的方法，而瘟疫真菌在不断反击的过程之中，脑发现了亚特种群的一些秘密，它们也有着自己的‘首脑’来指挥部队。
在发现这件事后，脑就想着要去感染亚特种群的首脑，以此来结束战斗，很快的它就通过分析信号等方式来确认了亚特种群的首脑位置。
当最初发现目标位置时，它准备了一支队伍去偷袭目标，亚特种群实际上也和脑一样，发现了瘟疫真菌有脑作为指挥者，于是它们的首脑想出了一种偷袭的方式去摧毁这个脑。
瘟疫真菌的脑发现了亚特种群的偷袭，它立刻聚集部队进行防守，同时它躲藏进了海底洞穴之内。
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