大宋朝的这次改革原本就是需要全面看待的，王安石、王安国兄弟，曾巩、曾布兄弟，韩维、韩绛兄弟，曾公亮、曾孝宽父子，吕公弼、吕嘉问爷孙都是一家人，却持不同政见。说明在大宋革新的问题上普遍存在不同见解，哪怕是进一家门的一家人也有不同看法。对待反改革派他薄情寡恩，对待改革派他也没有手下留情。
吕惠卿被贬后长期在西北前线，元丰五年（1082），丁母忧期满，神宗皇帝拟让他经略鄜延路。吕惠卿上疏说：“陕西之师不但不能进攻，也不能防守。”希望在三省、枢密院议事时，当面陈述自己的意见和建议。神宗皇帝大为恼怒，认为吕惠卿这道札子是试图借参与三省、枢密院议事，意在重回朝廷。这纯粹是杯弓蛇影，吕惠卿不是圣人君子，但绝对是经略过人，听听他的意见有何不妥？从日后的战绩来看，吕惠卿确实是文韬武略。神宗皇帝将这位曾经的执政大臣再次降级，贬到单州——一座边远的小城。
战场屡次失利对神宗皇帝的精神和身体是双重打击，元丰五年神宗皇帝开始抱病，经常称病不朝，之后日渐衰弱，几乎没有停止过用药。到元丰八年（1085），病情恶化，年仅三十八岁的神宗皇帝带着深深的遗憾永远的离开了这个世界。他用他的死来承担了征西夏失败的责任，称得上“君子”。大臣们拟定他的庙号时用了一个“神”字。《逸周书·谥法》：“民无能名曰神；壹民无为曰神；安仁立政曰神；物妙无方曰神；圣不可知曰神；阴阳不测曰神；治民无为曰神；应变远方、不疾而速曰神；能妙万物曰神；道化宜民曰神；显仁藏用曰神；则天广运曰神。”这里用“神”，显然不是治民无为，也不是道化宜民，而是“民无能名”——大家都不知道该怎样评价他！神宗皇帝一生为名留青史的所作所为换来了一个“神”的庙号，又透露着多少荒谬？神宗皇帝和他的“熙宁变法”、“元丰改制”，必将是一个树欲静而风不止的话题。
神宗皇帝短暂的一生却经历了历代王朝的普遍周期规律——凋零败落、改革发展、盛世崛起、军事扩展、战争消耗、再次面临凋零。神宗皇帝注定会和王安石一样永远不能盖棺定论，距离他们的时代太近，就有人会把自己的错误嫁祸到他们之上，好让他们背上黑锅。但随着时间的流逝，距离熙丰时代愈来愈久远，一个公允评价也愈来愈艰难，因为任何评价都具有时代的价值判断。
神宗皇帝绝不是什么昏君，和误国误民的楚怀王、楚顷襄王完全不同，那个时代不仅是屈原的悲哀，更是楚国的悲哀。他也不是李隆基，任用杨国忠、李林甫专权误国，亲手毁掉一个大唐盛世。神宗皇帝与王安石二人的君臣关系，是中国历史上除昏君与奸臣外，最亲密无间的君臣关系，是每一个有治国理想的臣子，梦幻中的君臣关系。他接手的是一个连先皇丧礼都没有钱办的帝国，帝国周围列强环伺，黄河水患、自然灾害连年不断。而他在位的18年，挽狂澜于既倒，对内统一思想，对外宣示主权，国库充满了又建。哪个人在历史的长河中不是一瞬？但神宗朝的这一瞬却是帝国历史上一个永恒的话题。